Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A13Q9NSD5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A13Q9NSD5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms