Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms