Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM10Q9NQV6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms