Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms