Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL4Q9C0H6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms