Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF17Q9BXT8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms