Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
THUMPD2Q9BTF0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
THUMPD2Q9BTF0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
THUMPD2Q9BTF0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
THUMPD2Q9BTF0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THUMPD2Q9BTF0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms