Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBF4Q9BQW3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms