Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3CQ99985 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms