Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CICQ96RK0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms