Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms