Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3DQ96BQ1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM3DQ96BQ1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM3DQ96BQ1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3DQ96BQ1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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