Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFT1Q96AA3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms