Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-CQ95604 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms