Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms