Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE6

LRRTM1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1Q86UE6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRTM1Q86UE6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms