Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms