Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms