Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KSR2Q6VAB6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KSR2Q6VAB6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms