Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
DUX4L9Q6RFH8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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DUX4L9Q6RFH8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DUX4L9Q6RFH8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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