Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
B4GALNT3Q6L9W6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4GALNT3Q6L9W6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms