Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC102BQ68D86 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms