Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZKSCAN2Q63HK3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms