Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF123Q5XPI4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms