Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GKAP1Q5VSY0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms