Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms