Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms