Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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