Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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