Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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