Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3GAP1Q15042 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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