Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHPRHQ149N8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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