Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPNMBQ14956 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPNMBQ14956 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms