Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS1Q14691 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS1Q14691 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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