Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms