Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCNIQ14094 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCNIQ14094 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms