Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL9A2Q14055 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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