Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCINQ13939 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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