Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATRQ13535 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ATRQ13535 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ATRQ13535 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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