Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms