Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP7AQ04656 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms