Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms