Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NHLH2Q02577 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms