Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms