Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC5Q00444 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms