Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms