Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF1P55201 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms