Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MVDP53602 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MVDP53602 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MVDP53602 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MVDP53602 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MVDP53602 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms