Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LUMP51884 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LUMP51884 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LUMP51884 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LUMP51884 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LUMP51884 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LUMP51884 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LUMP51884 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LUMP51884 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LUMP51884 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LUMP51884 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LUMP51884 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms