Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms